Nemocniční lékárna je součástí Nemocnice Prachatice a.s.. Jejím hlavním úkolem je zásobovat léky a prostředky zdravotnické techniky všechna oddělení nemocnice. Současně také provádí výdej léků na předpis pro širokou veřejnost a nabízí i sortiment volně prodejných léků, doplňků stravy, léčebné kosmetiky, dětský sortiment apod. Nabízíme i poradenství v oblasti užívání léků, jejich dávkování a kombinování, jak pro lékaře, tak pro pacienty.

V současné době je v lékárně zaměstnáno 8 lidí ( 2 magistři, 3 farmaceutické asistentky, 2 administrativní pracovníci a 1 sanitářka), všichni jsou běžnými zaměstanci nemocnice.